PCSS posiada dwa centra danych  zlokalizowane w Poznaniu:

• Główne przy ul. Jana Pawła II (BST, oddane do użytku w 2015 roku)
• Zapasowe przy ul. Wieniawskiego 17/19 (DCD).

Oba centra cechują się wysokim poziomem skalowalności oraz niezawodności. W szczególności BST i DCW mogą pracować w trybie uzupełniającym się jako główne (BST) i zapasowe (DCW), tzn. budynek BST jako główne centrum, a Wieniawskiego jako centrum zapasowe. Budynek BST i Wieniawskiego posiadają odpowiednio 1626 m² i 320 m² powierzchni na potrzeby instalacji urządzeń superkomputerowych (HPC), systemów chmurowych czy infrastruktury danych, w szczególności serwerów plików, macierzy dyskowych, SSD oraz bibliotek taśmowych.  Komunikacja pomiędzy centrami danych realizowana jest z wykorzystaniem dedykowanej, prywatnej sieci optycznej z kanałami komunikacyjnymi Ethernet 100 Gbit (i innymi technologiami włącznie z Infiniband, Fibre Channel, itp.).

Oddalone od siebie o 6 km zasilane są niezależnymi źródłami energii elektrycznej, pracują w pełni niezależnie od siebie, jednocześnie z możliwością uzupełniania swoich funkcjonalności oraz zwiększania niezawodności świadczonych przez PCSS usług. W obu lokalizacjach pomieszczenia serwerowe chronione są przed skutkami pożaru systemami wczesnego wykrywania dymu (Vesda), systemami detekcji pożaru oraz specjalistycznym  systemem gaszenia pożaru HI-FOG. Nadzór nad obydwoma centrami danych prowadzony jest przez centrum operacyjne NOC.

W BST zastosowano najnowocześniejsze systemy chłodzenia powietrzem oraz cieczą (DLC – direct liquid cooling), szczególnie DLC dla dużych systemów obliczeniowych charakteryzuje się bardzo wysoką efektywnością energetyczną.  W BST przeznaczono dwa pietra na instalacje sprzętu IT. Powierzchnia użytkowa sal komputerowych na każdym piętrze wynosi 813 m², w których na każdym piętrze można pomieścić około 208-240 szaf serwerowych w zależności od szerokości szaf oraz wymaganego chłodzenia. Piwnica budynku BST dedykowana jest dla pomieszczeń technicznych z układami zasilania, chłodzenia technologicznego oraz dla systemem gaszenia. Budynek BST zlokalizowany jest 6 km od centrum miasta, niedaleko Politechniki Poznańskiej. Po pracach modernizacyjnych przeprowadzonych w 2023 roku infrastruktura techniczna składa się z następujących elementów:

• Dwa transformatory o mocy 2,5 MVA przeznaczone dla torów zasilania systemów wysokiej dostępności,
• Zestaw 4 zasilaczy UPS o mocy 400 kVA każdy, pracujących w trybie nadmiarowym N+1,
• Agregat prądotwórczy o mocy 2,5 MVA,
• Dwa transformatory o mocy 2,5 MVA dedykowane dla systemów HPC,
• Dwa tory chłodzenia technologicznego o mocy 1,2 MW dla systemów wysokiej dostępności,
• Dwie chłodnice dedykowane dla obiegów chłodzenia DLC dla systemów HPC o łącznej mocy 1,7 MW.

Dodatkowe Centrum Danych zlokalizowane jest w budynku Polskiej Akademii Nauk (Wieniawskiego), w ścisłym centrum miasta. Centrum danych Wieniawskiego jest w pełni redundantne w zakresie dostawy energii elektrycznej (systemy obliczeniowe podłączone do dwóch niezależnych źródeł, a chronione przez systemy UPS i generatory prądu).

Oba centra stanowią „poligon doświadczalny” dla różnych technologii, począwszy od zasilania, poprzez systemy chłodzenia, monitorowania i zarządzania inteligentnego komponentami (od wentylatorów aż do systemów danych i przetwarzania), systemów wczesnego wykrywania i aktywnego gaszenia czy wykorzystania alternatywnych źródeł zasilania.  Budynki BST oraz DCW są podstawą budowy innych laboratoriów PCSS, w tym technologii HPC czy danych.   Stanowią również same w sobie laboratoriów badawcze wykorzystania i testowania nowych technologii.